朝阳市疾病预防控制中心于2003年正式成立，根据我市卫生监督与疾病预防控制体制改革精神，由原市卫生防疫站、职业病防治所、地方病防治所、健康教育所等四家预防保健机构组建而成。

朝阳市地处辽西贫困地区，疾控中心服务辐射人口335万人，其中农村人口占80%以上，由于受地理环境和经济发展水平等因素的制约，地方病（氟病、碘缺乏病）、以及建平县十个乡镇的鼠间鼠疫等防治形势严峻，性病艾滋病、病毒性肝炎、痢疾、风疹、麻疹、腮腺炎等相关传染性疾病预防控制任务十分艰巨，因病致贫、因病返贫的情况普遍存在；朝阳市卫生资源匮乏，基层医疗保健机构不完善，基层医疗设备落后，随着新传染病的出现，老传染病的卷土重来，以及慢性非传染性疾病的高发，预防保健工作面临前所未有的挑